Codex科研工作流文献管理论文写作Skill 选型

Codex 论文工作流:把检索还给工具,把加工交给 AI

一条可复用的 AI 科研协作链路:专用工具负责文献检索与溯源,Codex 与学术 Skill 负责加工、写作与自动化。本文按学科给出 Skill 选型表,拆解 Idea、写作、绘图、汇报四个高频环节的落地做法,并划出学术诚信的几条红线。

很多同学把「让 AI 写论文」理解成丢一个题目进去等成稿,结果拿回来的东西文献是编的、逻辑是散的。问题不在模型,在分工:检索与溯源是专用工具的活,加工与自动化才是 AI 的活。把这两件事拆开,整条链路立刻可靠。

下面这套流水线,核心就一句话:专用工具管「找」,Codex 管「用」。

文献这一段,别让 AI 直接上手

先说一个反直觉的结论:不要用 Codex Skill 直接检索文献。原因有三——AI 拿不到完整文献库,只看得见标题和摘要;检索覆盖不全;学术网站反爬严格,效率低,还容易在缺料时「补料」,也就是编造文献。

可靠的做法是三段接力:

  1. 调研交给专用工具。Undermind 适合深挖式调研,支持多轮追问、能产出带溯源的调研报告;Elicit 擅长按问题批量提取文献信息;Connected Papers 和 Research Rabbit 用引文网络扩展同域文献;Litmaps 的关系图谱适合快速看清一个方向的版图。
  2. 沉淀进 Zotero。调研产出统一入库,这一步是后面一切自动化的地基。
  3. Codex 读库加工。给 Codex 配上 Zotero 插件直接读你的库,让它做引用整理、脉络总结、投稿方向建议——这时候 AI 加工的是你验证过的资料,幻觉风险被压到最低。

Skill 怎么选:按学科对号入座

学术 Skill 生态已经相当丰富,与其全装,不如按学科挑两三个深用:

Skill 一句话定位 适合谁
Nature Skills 学术表达 + 科研绘图规范,子技能覆盖选题到投稿 通用、理科
Scientific Agent Skills 上百个科学数据库与专业工具包的封装 生物、化学、医学
Academic Research Skills 四库交叉验证引用、苏格拉底式打磨论证 通用、人文社科
codex-claude-academic-skills 中文科研三件套:算数据、写论文、出汇报 中文写作、工科
ARIS(Auto-Research-In-Sleep) 无人值守跑实验、调参、迭代 计算机、AI

获取渠道都在 GitHub,让 AI 自己去仓库找、按 README 安装即可;几十个 skill 共存时,非全局工具放进工作区就能避免互相干扰。提醒一句:这个生态周更迭代很快,安装前以仓库最新 README 为准。

这些 Skill 的介绍与来源链接,我们同步收录在了 Promptman 发现页的「学术研究」分类,可以按需取用。

四个高频环节的落地做法

Idea:先喂料,再拷问

空对话里问 AI 要 idea,得到的是平均水平的大路货。正确姿势是先投喂 10–20 篇领域内最相关的论文,让它吃透研究范式,再用 Academic Research Skills 这类带苏格拉底式追问的 Skill 反复拷问:最想让审稿人相信的最小命题是什么?砍到只剩一个创新点会留哪个?这是设计缺口,还是理解缺口?一个能写的 idea,通常要磨七八轮。

写作:学科对口,别用通用模型硬写

不同学科的论证结构和证据标准差别很大:自然科学吃数据和图表规范,人文社科吃论证链路。按上面的选型表给对应学科配 Skill,英文润色、引用格式、审稿回复都有专门的规程兜底,比裸模型硬写稳得多。

绘图:数据图和概念图要分开对待

数据图必须用 Python/HTML 代码从真实数据生成——可复现、可核查,可以放心进论文。workflow 图、概念图这类示意性内容,AI 生图模型只能当构图草稿,直接进论文有幻觉风险,最终版请自己画。

汇报与追踪:两个自动化红利

课程或组会汇报的 PPT,主流做法已经转向 HTML 生成(如 Frontier Slides、Frontier Design 这类工具),一两个小时能出质量可观的成品。更值钱的是论文日报:用 Codex 的 scheduled tasks 挂周期任务,每天自动推送某方向值得关注的论文、脉络总结和可深挖的子方向——换研究方向时改一下推送配置就行。这是整套流水线里最容易被忽略、长期收益最高的一环。

几条红线

  • 必须坚持自己读论文。AI 能压缩格式化劳动,压缩不了你对领域的理解;创新、细节和最终质量只能由研究者本人负责。
  • 无人值守的产出要复核。挂机跑出来的稿子、数据、引用,用前逐项验证,别让自动化替你背学术诚信的锅。
  • 引用只认验证过的来源。AI 给出的每条文献,先查证再使用。

把这条流水线装进 Promptman

文中提到的学术 Skill 与文献工具,已收录进 Promptman 发现页的「学术研究」分类,按分类浏览、一键复制:

  • 发现页入口:prompt.solokit.run/discover → 「学术研究」分类
  • 建议用法:专用工具完成调研并入库 Zotero,再到发现页按学科取用 Skill,配合 Codex 跑通「选题 → 文献 → idea → 写作 → 绘图」全链路。